Primero identifica cuanto almacenamiento tienes ocupado y cuando libre:

$ df -h

Luego debes ejecutar el comando siguiente para eliminar los paquetes que posiblemente no necesites en tu Raspberry Pi

$ sudo aptitude purge lxappearance lxde lxde-common lxde-core lxde-icon-theme lxinput lxmenu-data lxpanel lxpolkit lxrandr lxsession lxsession-edit  lxshortcut lxtask  lxterminal  xinit xserver-xorg lightdm scratch midori desktop-base desktop-file-utils gnome-icon-theme gnome-themes-standard leafpad menu-xdg omxplayer xarchiver zenity tk8.5 pcmanfm blt idle idle3 python-tk python3-tk dillo openbox

Luego de haberse desinstalado los paquetes vuelve a chequear cuanto espacio de almacenamiento tienes ocupado y cuanto libre.

$ df -h